Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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