Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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RABGGTAQ92696 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RABGGTAQ92696 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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