Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF12Q8WXF0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF12Q8WXF0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SRSF12Q8WXF0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms