Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PYDC1Q8WXC3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms