Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HJURPQ8NCD3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms