Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMNTD2Q8IXW0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms