Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRRC28Q86X40 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRRC28Q86X40 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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