Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00523Q86TU6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms