Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CATSPER4Q7RTX7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms