Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HMBOX1Q6NT76 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms