Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms