Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM46CQ5VWP2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM46CQ5VWP2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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