Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms