Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP188Q5SRE5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms