Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FREM1Q5H8C1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FREM1Q5H8C1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FREM1Q5H8C1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FREM1Q5H8C1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FREM1Q5H8C1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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