Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLFNL1Q499Z3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms