Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
KRTAP21-3Q3LHN1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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