Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms