Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDO1Q16878 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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