Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDKN3Q16667 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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