Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SGCBQ16585 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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