Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC18A3Q16572 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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