Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZIC1Q15915 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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