Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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