Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TWIST1Q15672 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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