Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CDSNQ15517 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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CDSNQ15517 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CDSNQ15517 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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