Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PTPRRQ15256 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PTPRRQ15256 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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