Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PCOLCEQ15113 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms