Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCNIQ14094 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms