Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTCH1Q13635 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms