Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CUL4BQ13620 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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