Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BFSP2Q13515 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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