Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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