Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF6Q13247 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF6Q13247 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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