Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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RPA4Q13156 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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