Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL28Q13084 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms