Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNIP1Q12981 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms