Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC10A2Q12908 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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