Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
STX4Q12846 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
STX4Q12846 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms