Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNH2Q12809 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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