Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TFCP2Q12800 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms