Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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