Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOX4Q06945 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms