Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GABPB1Q06547 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABPB1Q06547 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms