Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN11Q06124 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN11Q06124 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms