Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms