Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GCNT1Q02742 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GCNT1Q02742 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms