Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DSG1Q02413 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms