Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
OTUD4Q01804 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms