Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EXOSC10Q01780 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EXOSC10Q01780 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms